环状RNA( circular RNA,circRNA) 是一种特殊的选择性剪切产生且在真核细胞中广泛表达的环形内源性非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA) ,是继微小RNA (microRNA,miRNA) 及长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA) 后的RNA 家族又一研究新热点。circRNA 包括外显子构成的内源性RNA 分子和内含子来源的RNA 分子。circRNA 目前已经被证明广泛存在多种真核生物体中,目前常在果蝇、鼠、海马鱼及人类细胞及组织中。
特点:
o存在范围广泛,在真核生物体、病毒、类病毒以及古生菌中均发现存在circRNA,在真核生物体中,大部分circRNA 存在于胞浆中,易跨膜,少数存在于细胞核内.
o具有高表达性以及组织特异性,在不同的组织中,circRNA 的表达情况不同,且具有生长阶段表达差异性.
o相对于线性结构,circRNA 不含有poly A尾巴,不易被核酸外切酶裂解,在生物体中更加稳定地存在.
o外显子来源的circRNA 具有与对应的线性RNA 相同的转录序列,但不翻译成蛋白,为非编码RNA.
o具有高度物种保守性;
一些circRNA 能结合miRNA,并与miRNA 相互作用,同时在转录水平或转录后水平发挥着重要的调控作用.
形成:
目前发现的circRNA 来源于外显子或内含子.由外显子构成的circRNA 产生两种模型:一是直接反向剪接,两个内含子通过碱基互补配对,由下游的外显子3′端尾巴连接到上游外显子5′端头部,下游3′剪接供体结合上游5′剪接受体,使得两个内含子结合,而环化的外显子被释放;二是外显子跳读,套索驱动的环化与外显子跳读有关,通过一个外显子的跳跃,随之通过一个正常的剪接机制产生一个含有套索的外显子,然后进行反向剪接,最后内含子套索被释放,circRNA 产生
功能:
omiRNA吸附或海绵体功能
o调控母本基因的表达
o参与可变剪接的调控,发挥着重要作用